Masspektrometri för peptider – så bekräftas identiteten
Masspektrometri (MS) mäter förhållandet mellan massa och laddning (m/z) hos joner. För peptider används det för att bekräfta att molekylmassan stämmer med den förväntade sekvensen.
Så fungerar det
Den teoretiska molekylmassan beräknas från aminosyrasekvensen och jämförs med den uppmätta massan. Vanliga tekniker är elektrosprayjonisering (ESI), ofta kopplad till vätskekromatografi (LC-MS), och MALDI-TOF.
Flera laddningstillstånd
Vid ESI får samma peptid ofta flera laddningar, till exempel [M+2H]2+ och [M+3H]3+. Massan räknas då fram från flera toppar.
Vad MS visar och inte visar
Rätt massa stöder identiteten men visar inte hela sekvensen. Det gör tandem-MS (MS/MS), där peptiden fragmenteras. MS kombineras med HPLC för att bedöma både identitet och renhet.